lundi 31 août 2020

Les systèmes d'égouts peuvent être utilisés comme signes avant-coureurs du COVID-19

Au début de cette semaine, Robert Robbins, président de l'Université de l'Arizona, a reçu un appel téléphonique au sujet de la merde qui l'a aidé à arrêter une épidémie de COVID-19.

Dans le cadre du plan de retour sur le campus de l'école, l'université analysait les eaux usées des dortoirs sur le campus à la recherche de signes du coronavirus. Le professeur à la tête du projet appelait pour dire qu'il avait trouvé le virus dans les eaux usées d'un dortoir appelé Likins Hall .

Les administrateurs sont descendus dans le dortoir, ont testé chaque personne à l'intérieur et ont trouvé deux cas chez des personnes qui n'avaient pas de symptômes.

" Ce sera un outil très précieux pour nous aider à prendre les devants ", a déclaré Robbins lors d'un briefing aujourd'hui . Attraper des personnes infectées par le virus mais qui ne présentent pas de symptômes est essentiel pour arrêter sa propagation, a-t-il déclaré, et les eaux usées aidaient à les trouver.

Quand les gens tombent malades avec le COVID-19, le virus apparaît dans leurs excréments avant même qu'ils ne se sentent malades. Les matières fécales mouchetées de virus se frayent ensuite un chemin dans les réseaux d'égouts. La surveillance de ces eaux usées aide les responsables de la santé publique à surveiller toute propagation virale non détectée.

D'autres universités, comme celle du Michigan Hope College , utilise les eaux usées pour surveiller le COVID-19 sur le campus. Des villes comme New Haven, Connecticut et Carmel, Indiana, font la même chose.

Chaque jour, les travailleurs de la station d'épuration de New Haven siphonnent un peu d'eaux usées et les mettent dans une glacière. Ensuite, des chercheurs de l'Université de Yale passent pour le récupérer. Entre leurs mains, ce tas de déchets est un outil clé pour prédire la trajectoire de l'épidémie locale de COVID-19.

" Cela nous donne une meilleure idée de ce qui se passe dans la ville ", déclare l'épidémiologiste de New Haven Brian Weeks, qui utilise les données collectées par l'équipe de Yale.

L'équipe de recherche de Yale analyse les échantillons prélevés dans la station d'épuration et rapporte les niveaux de virus à la ville une fois par semaine, explique Jordan Peccia, professeur de génie chimique et environnemental à Yale travaillant sur le projet. Les échantillons collectés par Peccia et son équipe sont morceaux de boues d'épuration - le matériau concentré laissé lors du traitement des eaux usées. Lorsqu'ils ont comparé les niveaux de virus dans les boues avec le nombre de cas signalés dans la ville, ils ont constaté que les charges virales dans les boues augmentaient environ une semaine avant le décompte des cas." Cela pourrait donc être un avertissement précoce, "il dit.

Weeks dit qu'il regarde les données sur les boues d'épuration alors que New Haven commence à rouvrir.

"W Nous nous attendons à ce que les cas reprennent parce que les gens avancent dans leur vie, interagissent avec la communauté, vont au restaurant et prennent les transports en commun. Inévitablement, il y aura une opportunité accrue de visibilité », dit-il. «Cela nous donnera l'occasion d'agir un peu plus vite que de dépendre des données hospitalières.»

À environ 800 miles de là, Carmel, Indiana, adopte la même approche.

"C'est un moyen de voir si nous avons un pic, nous savons que nous devons faire appel à une partie de notre réouverture", a déclaré le maire du Carmel Jim Brainard à The Verge . "J'espère que ce n'est pas nécessaire, mais au moins nous avons les données nécessaires pour prendre une décision éclairée."

Brainard et le directeur des services publics de la ville ont tous deux pris connaissance des tests des eaux usées fin avril. Ils ont décidé de s'associer à la société de biotechnologie Biobot, basée au Massachusetts, qui collecte et analyse des échantillons d'eaux usées de tout le pays. Le délai d'exécution, cependant,C'est lent, dit Brainard - ils n'ont récupéré qu'un seul échantillon jusqu'à présent, mais espèrent obtenir plus de résultats cette semaine. La ville envisage de s'associer à un laboratoire de l'Université de Notre-Dame pour effectuer l'analyse localement. «Nous n’aurions pas besoin de FedEx du jour au lendemain, nous pourrions simplement le conduire là-bas», dit-il.

Le délai d'exécution de Biobot a été lent en mars et avril car il s'agissait d'un service gratuit, a déclaré la porte-parole Sarah Pugsley dans un e-mail à The Verge. "Compte tenu de la forte demande pour ces tests, nous les proposons désormais en tant que service payant, qui a débuté le 1er juin avec un délai garanti de 3 à 7 jours pour démarrer, tout en visant à l'obtenir en 3 jours", at-elle m'a dit.

Une fois que les données sur les eaux usées seront disponibles de manière plus cohérente, Brainard dit qu'elles seront rapportées publiquement de la même manière que les nombres de cas. Il espère également qu'ils pourront éventuellement tester les eaux usées de bâtiments spécifiques, en plus de la ville dans son ensemble. «Geico, par exemple, a une grande installation ici», dit-il. En théorie, ils pourraient prélever des échantillons d'eaux usées dans un regard juste à l'extérieur du bâtiment. "Ensuite, si nous voyons un pic dans ce bâtiment, nous pourrions faire effectuer un test à tout le monde dans ce bâtiment dans quelques jours, découvrir qui le propage, lancer la quarantaine et effectuer le suivi des contacts."

Weeks espère que New Haven pourra également tester des installations individuelles. «Nous espérons obtenir à l’avenir des données provenant de sites importants, comme les maisons de retraite médicalisées et d’endroits de ce genre», dit-il.

Les niveaux de coronavirus dans les eaux usées ne sont qu'une seule donnée que New Haven utilise pour surveiller son épidémie, dit Weeks, ainsi que le nombre de cas et les taux d'hospitalisation. Mais c’est un ajout précieux, dit-il. "Marier ces différents ensembles de données, s'ils sont tous alignés, c'est phénoménal."

Mise à jour le 27 août, 17 h 14 : mise à jour avec des informations sur les collèges et universités.

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